Joonatan ja Jonatan ovat miehen etunimiä. Joonatan on nimen suomenkielinen muoto, monissa muissa kielissä nimi esiintyy muodossa Jonatan tai Jonathan. Suomessa nimi on ollut harvinaisena käytössä jo 1800-luvulla, mutta on yleistynyt vasta 1980-luvulta lähtien. Vuoden 2019 loppuun mennessä nimi Joonatan on Suomessa annettu noin 7 800:lle, Jonatan noin 1 780:lle ja Jonathan noin 3 140 henkilölle.